Полиморфные сайты в ITS-районах ядерных генов 35S рРНК у межвидовых гибридов Pulsatilla (Ranunculaceae)
УДК 582.675.1
DOI:
https://doi.org/10.14258/pbssm.2019010Ключевые слова:
Межвидовая гибридизация, Pulsatilla, внутригеномный полиморфизмАннотация
Исследовано распределение полиморфных сайтов (PS) в ITS-районах ядерных генов 35S рРНК у образцов из нескольких местонахождений трех видов рода Pulsatilla (P. patens, P. vernalis, P. pratensis) и их попарныхмежвидовых гибридов (P. × intermedia, P. × spuria, P. × wolfgangiana). Количество и положение PS варьировалокак внутри каждого вида и нотовида, так и между ними. Некоторые PS можно рассматривать как сохранившиеся свидетельства гибридизации, другие – как результат геномной нестабильности гибрида. В сети NeighbourNetбольшинство гибридов заняли промежуточное положение между видовыми кластерами. Положение образцовP. × intermedia внутри видовых кластеров P. patens может свидетельствовать об их интрогрессивной природе.
Скачивания
Данные по скачиваниям пока не доступны.
Библиографические ссылки
Гельтман Д. В. Pulsatilla pratensis. P. vernalis – Красная книга Российской Федерации (растения и грибы). – М.: Товарищество научных изданий КМК, 2008. – С. 483–485.
Гельтман Д. В. Pulsatilla patens, P. pratensis. P. vernalis // Красная книга Ленинградской области. Объекты растительного мира. – СПб.: Марафон, 2018. – С. 229–230, 762–764.
Ефимов С. В., Дегтярева Г. В., Терентьева Е. И. и др. Изучение полиморфизма ампликонов ITS1 и ITS2 ядерной рибосомальной ДНК с помощью высокопроизводительного параллельного секвенирования и прямого секвенирования по Сэнгеру у Paeonia lactiflora (Paeoniaceae) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2017. – № 16. – С. 246–249.
Пунина E. O., Гриф В. Г. Кариосистематическое исследование видов и естественных гибридов рода Pulsatilla (Ranunculaceae) в Ленинградской области // Бот. журн., 1984. – Т. 69, № 12. – С. 1673–1678.
Родионов А. В., Амосова А. В., Беляков Е. А. и др. Генетические последствия межвидовой гибридизации, ее роль в видообразовании и фенотипическом разнообразии растений // Генетика, 2019. – Т. 55, № 3. – С. 255–272.
Huson D. H., Bryant D. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies // Mol. Biol. Evol., 2006. – V. 23, № 2. – P. 254–267.
Kotseruba V., Gernand D., Meister A. et al. Uniparental loss of ribosomal DNA in the allotetraploid grass Zingeria trichopoda (2n = 8) // Genome., 2003. – V. 46. – P. 156–163.
Kovarik A., Dadejova M., Lim Y. K. et al. Evolution of rDNA in Nicotiana allopolyploids: A potentia link between rDNA homogenization and epigenetics // Ann. Bot., 2008. – V. 101. – P. 815–823.
Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. Evol., 2016. – V. 33, № 7. – P. 1870–1874.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Interspecific hybridization in the genus Paeonia (Paeoniaceae): polymorphic sites in transcribed spacers of the 45S rRNA genes as indicators of natural and artificial peony hybrids // Russ. J. of Genetics, 2012. – V. 48, № 7. – С. 684–697.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Polymorphic sites in transcribed spacers of 35s rRNA genes as an indicator of origin of the paeonia cultivars // Russ. J. of Genetics, 2017. – V. 53, № 2. – С. 202–212.
Rodionov A. V., Gnutikov A. A., Kotsinyan A. R., Kotseruba V. V. , Nosov N. N., Punina E. O., Rayko M. P., Tyupa N. B., Kim E. S. ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequence in 35S rRNA genes as marker during reconstruction of phylogeny of cereals (Poaceae family) // Biology Bulletin Reviews, 2017. – V. 7. – № 2. – С. 85–102.
Rodionov A. V., Dobryakova K. S., Punina E. O. Polymorphic sites in ITS1–5.8S rDNA–ITS2 region in hybridogenic genus × Elyhordeum and putative interspecific hybrids Elymus (Poaceae: Triticeae) // Russ. J. of Genetics, 2018. –V. 54, № 9. – С. 1025–1039.
Sang T., Crawford D. J., Stuessy T. F. Documentation of reticulate evolution in peonies (Paeonia) using internal transcribed spacer sequences of nuclear ribosomal DNA: implications for biogeography and concerted evolution // Proc. Natl Acad. Sci. USA., 1995. – V. 92. – P. 6813–6817.
Гельтман Д. В. Pulsatilla patens, P. pratensis. P. vernalis // Красная книга Ленинградской области. Объекты растительного мира. – СПб.: Марафон, 2018. – С. 229–230, 762–764.
Ефимов С. В., Дегтярева Г. В., Терентьева Е. И. и др. Изучение полиморфизма ампликонов ITS1 и ITS2 ядерной рибосомальной ДНК с помощью высокопроизводительного параллельного секвенирования и прямого секвенирования по Сэнгеру у Paeonia lactiflora (Paeoniaceae) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2017. – № 16. – С. 246–249.
Пунина E. O., Гриф В. Г. Кариосистематическое исследование видов и естественных гибридов рода Pulsatilla (Ranunculaceae) в Ленинградской области // Бот. журн., 1984. – Т. 69, № 12. – С. 1673–1678.
Родионов А. В., Амосова А. В., Беляков Е. А. и др. Генетические последствия межвидовой гибридизации, ее роль в видообразовании и фенотипическом разнообразии растений // Генетика, 2019. – Т. 55, № 3. – С. 255–272.
Huson D. H., Bryant D. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies // Mol. Biol. Evol., 2006. – V. 23, № 2. – P. 254–267.
Kotseruba V., Gernand D., Meister A. et al. Uniparental loss of ribosomal DNA in the allotetraploid grass Zingeria trichopoda (2n = 8) // Genome., 2003. – V. 46. – P. 156–163.
Kovarik A., Dadejova M., Lim Y. K. et al. Evolution of rDNA in Nicotiana allopolyploids: A potentia link between rDNA homogenization and epigenetics // Ann. Bot., 2008. – V. 101. – P. 815–823.
Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. Evol., 2016. – V. 33, № 7. – P. 1870–1874.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Interspecific hybridization in the genus Paeonia (Paeoniaceae): polymorphic sites in transcribed spacers of the 45S rRNA genes as indicators of natural and artificial peony hybrids // Russ. J. of Genetics, 2012. – V. 48, № 7. – С. 684–697.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Polymorphic sites in transcribed spacers of 35s rRNA genes as an indicator of origin of the paeonia cultivars // Russ. J. of Genetics, 2017. – V. 53, № 2. – С. 202–212.
Rodionov A. V., Gnutikov A. A., Kotsinyan A. R., Kotseruba V. V. , Nosov N. N., Punina E. O., Rayko M. P., Tyupa N. B., Kim E. S. ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequence in 35S rRNA genes as marker during reconstruction of phylogeny of cereals (Poaceae family) // Biology Bulletin Reviews, 2017. – V. 7. – № 2. – С. 85–102.
Rodionov A. V., Dobryakova K. S., Punina E. O. Polymorphic sites in ITS1–5.8S rDNA–ITS2 region in hybridogenic genus × Elyhordeum and putative interspecific hybrids Elymus (Poaceae: Triticeae) // Russ. J. of Genetics, 2018. –V. 54, № 9. – С. 1025–1039.
Sang T., Crawford D. J., Stuessy T. F. Documentation of reticulate evolution in peonies (Paeonia) using internal transcribed spacer sequences of nuclear ribosomal DNA: implications for biogeography and concerted evolution // Proc. Natl Acad. Sci. USA., 1995. – V. 92. – P. 6813–6817.
Загрузки
Опубликован
2019-07-08
Выпуск
Раздел
Молекулярно-генетические методы в исследовании растений и хемосистематика
Как цитировать
Полиморфные сайты в ITS-районах ядерных генов 35S рРНК у межвидовых гибридов Pulsatilla (Ranunculaceae): УДК 582.675.1. (2019). Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 18(1), 57-61. https://doi.org/10.14258/pbssm.2019010
