Polymorphic sites in ITS1–5.8S rDNA–ITS2 region of nuclear 35S rRNA genes in interspecies hybrids of Pulsatilla (Ranunculaceae)
УДК 582.675.1
DOI:
https://doi.org/10.14258/pbssm.2019010Keywords:
Interspecific hybridization, Pulsatilla, intragenomic polymorphismAbstract
The distribution patterns of polymorphic sites (PS) in ITS1–5.8S rDNA–ITS2 region of nuclear 35S rRNAgenes of three species of the genus Pulsatilla (P. patens, P. vernalis, P. pratensis) and their hybrids (P. × intermedia,P. × spuria, P. × wolfgangiana) in multiple samples from different locations were studied. The number and position of PSvaried within each species and nothospecies as well as between them. Some PS can be considered as persistent evidenceof past hybridization, whereas others as the result of genomic non-stability in a hybrid. Most of hybrid samples took intermediate place among clusters corresponding to species in NeighbourNet graph. The position of P. × intermedia sampleswithin P. patens cluster can be evidence of their introgressive nature.
Downloads
Download data is not yet available.
References
Гельтман Д. В. Pulsatilla pratensis. P. vernalis – Красная книга Российской Федерации (растения и грибы). – М.: Товарищество научных изданий КМК, 2008. – С. 483–485.
Гельтман Д. В. Pulsatilla patens, P. pratensis. P. vernalis // Красная книга Ленинградской области. Объекты растительного мира. – СПб.: Марафон, 2018. – С. 229–230, 762–764.
Ефимов С. В., Дегтярева Г. В., Терентьева Е. И. и др. Изучение полиморфизма ампликонов ITS1 и ITS2 ядерной рибосомальной ДНК с помощью высокопроизводительного параллельного секвенирования и прямого секвенирования по Сэнгеру у Paeonia lactiflora (Paeoniaceae) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2017. – № 16. – С. 246–249.
Пунина E. O., Гриф В. Г. Кариосистематическое исследование видов и естественных гибридов рода Pulsatilla (Ranunculaceae) в Ленинградской области // Бот. журн., 1984. – Т. 69, № 12. – С. 1673–1678.
Родионов А. В., Амосова А. В., Беляков Е. А. и др. Генетические последствия межвидовой гибридизации, ее роль в видообразовании и фенотипическом разнообразии растений // Генетика, 2019. – Т. 55, № 3. – С. 255–272.
Huson D. H., Bryant D. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies // Mol. Biol. Evol., 2006. – V. 23, № 2. – P. 254–267.
Kotseruba V., Gernand D., Meister A. et al. Uniparental loss of ribosomal DNA in the allotetraploid grass Zingeria trichopoda (2n = 8) // Genome., 2003. – V. 46. – P. 156–163.
Kovarik A., Dadejova M., Lim Y. K. et al. Evolution of rDNA in Nicotiana allopolyploids: A potentia link between rDNA homogenization and epigenetics // Ann. Bot., 2008. – V. 101. – P. 815–823.
Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. Evol., 2016. – V. 33, № 7. – P. 1870–1874.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Interspecific hybridization in the genus Paeonia (Paeoniaceae): polymorphic sites in transcribed spacers of the 45S rRNA genes as indicators of natural and artificial peony hybrids // Russ. J. of Genetics, 2012. – V. 48, № 7. – С. 684–697.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Polymorphic sites in transcribed spacers of 35s rRNA genes as an indicator of origin of the paeonia cultivars // Russ. J. of Genetics, 2017. – V. 53, № 2. – С. 202–212.
Rodionov A. V., Gnutikov A. A., Kotsinyan A. R., Kotseruba V. V. , Nosov N. N., Punina E. O., Rayko M. P., Tyupa N. B., Kim E. S. ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequence in 35S rRNA genes as marker during reconstruction of phylogeny of cereals (Poaceae family) // Biology Bulletin Reviews, 2017. – V. 7. – № 2. – С. 85–102.
Rodionov A. V., Dobryakova K. S., Punina E. O. Polymorphic sites in ITS1–5.8S rDNA–ITS2 region in hybridogenic genus × Elyhordeum and putative interspecific hybrids Elymus (Poaceae: Triticeae) // Russ. J. of Genetics, 2018. –V. 54, № 9. – С. 1025–1039.
Sang T., Crawford D. J., Stuessy T. F. Documentation of reticulate evolution in peonies (Paeonia) using internal transcribed spacer sequences of nuclear ribosomal DNA: implications for biogeography and concerted evolution // Proc. Natl Acad. Sci. USA., 1995. – V. 92. – P. 6813–6817.
Гельтман Д. В. Pulsatilla patens, P. pratensis. P. vernalis // Красная книга Ленинградской области. Объекты растительного мира. – СПб.: Марафон, 2018. – С. 229–230, 762–764.
Ефимов С. В., Дегтярева Г. В., Терентьева Е. И. и др. Изучение полиморфизма ампликонов ITS1 и ITS2 ядерной рибосомальной ДНК с помощью высокопроизводительного параллельного секвенирования и прямого секвенирования по Сэнгеру у Paeonia lactiflora (Paeoniaceae) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2017. – № 16. – С. 246–249.
Пунина E. O., Гриф В. Г. Кариосистематическое исследование видов и естественных гибридов рода Pulsatilla (Ranunculaceae) в Ленинградской области // Бот. журн., 1984. – Т. 69, № 12. – С. 1673–1678.
Родионов А. В., Амосова А. В., Беляков Е. А. и др. Генетические последствия межвидовой гибридизации, ее роль в видообразовании и фенотипическом разнообразии растений // Генетика, 2019. – Т. 55, № 3. – С. 255–272.
Huson D. H., Bryant D. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies // Mol. Biol. Evol., 2006. – V. 23, № 2. – P. 254–267.
Kotseruba V., Gernand D., Meister A. et al. Uniparental loss of ribosomal DNA in the allotetraploid grass Zingeria trichopoda (2n = 8) // Genome., 2003. – V. 46. – P. 156–163.
Kovarik A., Dadejova M., Lim Y. K. et al. Evolution of rDNA in Nicotiana allopolyploids: A potentia link between rDNA homogenization and epigenetics // Ann. Bot., 2008. – V. 101. – P. 815–823.
Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. Evol., 2016. – V. 33, № 7. – P. 1870–1874.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Interspecific hybridization in the genus Paeonia (Paeoniaceae): polymorphic sites in transcribed spacers of the 45S rRNA genes as indicators of natural and artificial peony hybrids // Russ. J. of Genetics, 2012. – V. 48, № 7. – С. 684–697.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. et al. Polymorphic sites in transcribed spacers of 35s rRNA genes as an indicator of origin of the paeonia cultivars // Russ. J. of Genetics, 2017. – V. 53, № 2. – С. 202–212.
Rodionov A. V., Gnutikov A. A., Kotsinyan A. R., Kotseruba V. V. , Nosov N. N., Punina E. O., Rayko M. P., Tyupa N. B., Kim E. S. ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequence in 35S rRNA genes as marker during reconstruction of phylogeny of cereals (Poaceae family) // Biology Bulletin Reviews, 2017. – V. 7. – № 2. – С. 85–102.
Rodionov A. V., Dobryakova K. S., Punina E. O. Polymorphic sites in ITS1–5.8S rDNA–ITS2 region in hybridogenic genus × Elyhordeum and putative interspecific hybrids Elymus (Poaceae: Triticeae) // Russ. J. of Genetics, 2018. –V. 54, № 9. – С. 1025–1039.
Sang T., Crawford D. J., Stuessy T. F. Documentation of reticulate evolution in peonies (Paeonia) using internal transcribed spacer sequences of nuclear ribosomal DNA: implications for biogeography and concerted evolution // Proc. Natl Acad. Sci. USA., 1995. – V. 92. – P. 6813–6817.
Downloads
Published
2019-07-08
Issue
Section
Molecular methods in the study of plants and chemosystematics
How to Cite
Polymorphic sites in ITS1–5.8S rDNA–ITS2 region of nuclear 35S rRNA genes in interspecies hybrids of Pulsatilla (Ranunculaceae): УДК 582.675.1. (2019). Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 18(1), 57-61. https://doi.org/10.14258/pbssm.2019010
