Identification of collection samples of the genus Spiraea L. (Rosaceae) of the Botanical garden of the Institute of Biology of Komi SC UrB RAS according molecular data
УДК 582.639.3:575:061:62:58(470.13)
DOI:
https://doi.org/10.14258/pbssm.2019013Keywords:
Botanical garden, identification, ITS-region, nucleotide sequence, rDNA, Spiraea, taxonomyAbstract
The genus Spiraea L. of the subfamily Spiraeoideae of the Rosaceae family is taxonomically complex. Weconducted molecular genetic studies to identify taxa of the genus. The ITS sequences of ribosomal DNA of 21 Spiraeasamples including one wild sample of the local species of Spiraea media are obtained. Some of these ITS fragments werefirst sequenced.
Downloads
Download data is not yet available.
References
Бонюк З. Г. Таволги (Spiraea L.). – Киев: ВПЦ Киівский університет, 2008. – 248 с.
Мамаев С. А., Семкина Л. А. Интродуцированные деревья и кустарники Урала (розоцветные). -Свердловск: АН СССР, УО, 1988. – 105 с
Полякова Т. А., Шатохина А.В., Ширманов М.В., Бондаренко Г.Н. Оценка таксономических отношений у сибирских представителей секции Chamaedryon Ser. рода Spiraea L. (Rosaceae Juss.) на основе анализа нуклеотидного полиморфизма ITS–региона // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии : сб. науч. ст. по материалам Четырнадцатой междунар. науч.-практ. конф. (Барнаул, 25–29 мая 2015 г.). – Барнаул: Изд–во АлтГУ, 2015. – С. 353–358.
Шульгина В. В. Род Таволга – Spiraea L. // Деревья и кустарники СССР. – Т. 3. – М.–Л., 1954. – С. 286–332
BLAST: Basic local alignment search tool, 2018 URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (Дата обращения 02.12.2018)
GenBank Home, 2018. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/. (Дата обращения 14.01.2019)
Huh M. K., Huh H. W., Lee S. Y. A taxonomic study of the genus Spiraea in Korea using sequences of ITS // Journal of Life Science, 2008. – Vol. 18. – № 5. – P. 694–700.
Huh M. K. Analysis of the phylogenetic relationships in the genus Spiraea based on the nuclear ribosomal DNA ITS region // Journal of Life Science, 2012. – № 22. – P. 285–292
Potter D., Still S. M., Grebenc T., Ballian D., Bozic G., Franjiae J., Kraigher H. Phylogenetic relationships in tribe Spiraeae (Rosaceae) inferred from nucleotide sequence data // Plant Syst. Evol., 2007. – № 266 (1-2). – P. 105–118.
Zhang Z., Fan L., Yang J., Hao X., Gu Z. Alkaloid polymorphism and ITS sequence variation in the Spiraea japonica complex (Rosaceae) in China: traces of the biological effects of the Himalaya–Tibet Plateau uplift. // Am. J. Bot., 2006. – № 93 (5). – P. 762–769.
Мамаев С. А., Семкина Л. А. Интродуцированные деревья и кустарники Урала (розоцветные). -Свердловск: АН СССР, УО, 1988. – 105 с
Полякова Т. А., Шатохина А.В., Ширманов М.В., Бондаренко Г.Н. Оценка таксономических отношений у сибирских представителей секции Chamaedryon Ser. рода Spiraea L. (Rosaceae Juss.) на основе анализа нуклеотидного полиморфизма ITS–региона // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии : сб. науч. ст. по материалам Четырнадцатой междунар. науч.-практ. конф. (Барнаул, 25–29 мая 2015 г.). – Барнаул: Изд–во АлтГУ, 2015. – С. 353–358.
Шульгина В. В. Род Таволга – Spiraea L. // Деревья и кустарники СССР. – Т. 3. – М.–Л., 1954. – С. 286–332
BLAST: Basic local alignment search tool, 2018 URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (Дата обращения 02.12.2018)
GenBank Home, 2018. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/. (Дата обращения 14.01.2019)
Huh M. K., Huh H. W., Lee S. Y. A taxonomic study of the genus Spiraea in Korea using sequences of ITS // Journal of Life Science, 2008. – Vol. 18. – № 5. – P. 694–700.
Huh M. K. Analysis of the phylogenetic relationships in the genus Spiraea based on the nuclear ribosomal DNA ITS region // Journal of Life Science, 2012. – № 22. – P. 285–292
Potter D., Still S. M., Grebenc T., Ballian D., Bozic G., Franjiae J., Kraigher H. Phylogenetic relationships in tribe Spiraeae (Rosaceae) inferred from nucleotide sequence data // Plant Syst. Evol., 2007. – № 266 (1-2). – P. 105–118.
Zhang Z., Fan L., Yang J., Hao X., Gu Z. Alkaloid polymorphism and ITS sequence variation in the Spiraea japonica complex (Rosaceae) in China: traces of the biological effects of the Himalaya–Tibet Plateau uplift. // Am. J. Bot., 2006. – № 93 (5). – P. 762–769.
Downloads
Published
2019-06-17
Issue
Section
Molecular methods in the study of plants and chemosystematics
How to Cite
Identification of collection samples of the genus Spiraea L. (Rosaceae) of the Botanical garden of the Institute of Biology of Komi SC UrB RAS according molecular data: УДК 582.639.3:575:061:62:58(470.13) . (2019). Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 18(1), 72-74. https://doi.org/10.14258/pbssm.2019013
