Species determination in Liparis (Orchidaceae) based on morphological and molecular data on the territory of “Muravyevsky park of sustainable use of natural resources”
УДК 575.222.582.594.6(470)
DOI:
https://doi.org/10.14258/pbssm.2019014Keywords:
Amur region, ITS, Liparis, Orchidaceae, phylogenyAbstract
The species of the genus Liparis were sampled on the territory of “Muravyevsky park of sustainable useof natural resources”, initial definition of plants was conducted in nature. Morphological characters are insufficient forthe species determination of the genus Liparis, so for to assess species identity of representatives of natural populationsfragments of plants were taken for molecular phylogenetic studies. The internal transcribed spacers (ITS1 and ITS2)of fragment of 18S–26S nuclear ribosomal DNA were selected as a molecular marker for molecular analyses. Therepresentatives of the research populations of the genus Liparis have separated in the two well-supported clades in themolecular phylogenetic tree. The ITS sequences of analyzed plants of each clade have specific replacement. Analysis ofmorphological characters and molecular data allowed us to conduct species identification of representatives of naturalpopulations of the genus Liparis.
Downloads
Download data is not yet available.
References
Варлыгина Е. И., Дегтярева Г. В., Ефимов С. В., Терентьева Е. И. Популяционные исследования орхидных в заповеднике «Кедровая падь» // Биота и среда заповедников Дальнего Востока, 2017. –– Т. 1, № 10. –– С. 67–83.
Вахрамеева М. Г., Варлыгина Т. И., Татаренко И. В. // Орхидные России (биология, экология и охрана). ––М.: Товарищество научных изданий КМК, 2014. –– 437 с.
Дарман Г. Ф. Флора территории Муравьевского природного парка // Учёные записки ЗабГУ, 2015. – Т. 60, вып.1. – С. 11 – 16.
Ефимов П. Г. Род Liparis (Orchidaceae) на территории России // Бот. журн., 2010. –– Т. 95, № 10. –– С. 1458– 1480.
Камелин Р. В., Новиков В. С. Растения и грибы // Красная книга Российской Федерации.— М.: Товарищество научных изданий КМК, 2008. –– Т. 1. –– 855 с.
Невский С. А. Род Liparis L. C. Rich. // Флора СССР. – Л.: Изд-во АНСССР, 1935. – Т. 4. – С. 601–604.
Шибнева И. В. Liparis kumokiri (Orchidaceae) на Дальнем Востоке России // Бот. журн., 2004. ––Т. 89, № 10. – С. 1633–1636.
Шибнева И. В. Виды рода Liparis (Orchidaceae) на юге материковой части Дальнего Востока России // Фундаментальные и прикладные проблемы ботаники в начале XXI века, Петрозаводск, 22–27 сент. 2008 г.: материалы Всерос. конф. Петрозаводск: Карельский научный центр, 2008. Ч. 3. С. 148–150.
Шибнева И. В. Заметки о видах рода Liparis (Orchidaceae) из Приморского края // Растения в муссонном климате, Владивосток, 10–13 окт. 2006 г.: материалы Всерос. конф. Владивосток, 2007. – С. 264–268.
Edgar, R. C. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput // Nucleic Acids Research, 2004. – Vol.32. – P. 1792–1797.
Hall, T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/ NT. Nucl. Acids Symp., 1999. – Ser. 41. – P. 95–98.
Kim S. N., Kim Y. S. Morphological and cytological Study on genus Liparis in Korea // Kor. J. Plant Tax., 1986. – Vol. 16. – P. 59–88.
Liang Z., Wei W., Yi R., Julien B. B. Floral Development in Asteropyrum (Ranunculaceae):Implications for ITS Systematic Position // Annales Botanici Fennici, 2012. Vol. 49, No.1–2. P. 31–42.
Ohwi J. Flora of Japan. – Washington, 1965. – 1067 p.
Ronquist F. R., Huelsenbeck J. P. MrBAYES 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models // Bioinformatics,2003. No 19. P. 1572–1574.
Su Y. Y., Huang Y. L., Chen L. J., Zhang P. W., Liu Z. J., Zhang G. Q. Liparis wenshanensis, a new orchid species from China; Evidence from morphological and molecular analyses // Phytotaxa, 2015. Vol. 204, No.4. P. 253–264.
Swofford D. L. PAUP*: version 4.0. Sunderland, Massachusetts: Inc. Publishers, Sinauer Associates, 2003.
Tsutsumi C., Yukawa T., Lee N. S et al. Phylogeny and comparative seed morphology of epiphytic and terrestrial species of Liparis (Orchidaceae) in Japan. // Plant Res., 2007. – Vol.120. – P.405–412.
Valiejo-Roman C. M., Terentieva E. I., Samigullin T. H., Pimenov M. G. Relationships among genera in Saniculoideae (Umbelliferae) and connected taxa inferred from ITS sequences of nuclear ribosomal DNA // Taxon, 2002. – Vol. 51. – P. 91–101.
Вахрамеева М. Г., Варлыгина Т. И., Татаренко И. В. // Орхидные России (биология, экология и охрана). ––М.: Товарищество научных изданий КМК, 2014. –– 437 с.
Дарман Г. Ф. Флора территории Муравьевского природного парка // Учёные записки ЗабГУ, 2015. – Т. 60, вып.1. – С. 11 – 16.
Ефимов П. Г. Род Liparis (Orchidaceae) на территории России // Бот. журн., 2010. –– Т. 95, № 10. –– С. 1458– 1480.
Камелин Р. В., Новиков В. С. Растения и грибы // Красная книга Российской Федерации.— М.: Товарищество научных изданий КМК, 2008. –– Т. 1. –– 855 с.
Невский С. А. Род Liparis L. C. Rich. // Флора СССР. – Л.: Изд-во АНСССР, 1935. – Т. 4. – С. 601–604.
Шибнева И. В. Liparis kumokiri (Orchidaceae) на Дальнем Востоке России // Бот. журн., 2004. ––Т. 89, № 10. – С. 1633–1636.
Шибнева И. В. Виды рода Liparis (Orchidaceae) на юге материковой части Дальнего Востока России // Фундаментальные и прикладные проблемы ботаники в начале XXI века, Петрозаводск, 22–27 сент. 2008 г.: материалы Всерос. конф. Петрозаводск: Карельский научный центр, 2008. Ч. 3. С. 148–150.
Шибнева И. В. Заметки о видах рода Liparis (Orchidaceae) из Приморского края // Растения в муссонном климате, Владивосток, 10–13 окт. 2006 г.: материалы Всерос. конф. Владивосток, 2007. – С. 264–268.
Edgar, R. C. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput // Nucleic Acids Research, 2004. – Vol.32. – P. 1792–1797.
Hall, T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/ NT. Nucl. Acids Symp., 1999. – Ser. 41. – P. 95–98.
Kim S. N., Kim Y. S. Morphological and cytological Study on genus Liparis in Korea // Kor. J. Plant Tax., 1986. – Vol. 16. – P. 59–88.
Liang Z., Wei W., Yi R., Julien B. B. Floral Development in Asteropyrum (Ranunculaceae):Implications for ITS Systematic Position // Annales Botanici Fennici, 2012. Vol. 49, No.1–2. P. 31–42.
Ohwi J. Flora of Japan. – Washington, 1965. – 1067 p.
Ronquist F. R., Huelsenbeck J. P. MrBAYES 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models // Bioinformatics,2003. No 19. P. 1572–1574.
Su Y. Y., Huang Y. L., Chen L. J., Zhang P. W., Liu Z. J., Zhang G. Q. Liparis wenshanensis, a new orchid species from China; Evidence from morphological and molecular analyses // Phytotaxa, 2015. Vol. 204, No.4. P. 253–264.
Swofford D. L. PAUP*: version 4.0. Sunderland, Massachusetts: Inc. Publishers, Sinauer Associates, 2003.
Tsutsumi C., Yukawa T., Lee N. S et al. Phylogeny and comparative seed morphology of epiphytic and terrestrial species of Liparis (Orchidaceae) in Japan. // Plant Res., 2007. – Vol.120. – P.405–412.
Valiejo-Roman C. M., Terentieva E. I., Samigullin T. H., Pimenov M. G. Relationships among genera in Saniculoideae (Umbelliferae) and connected taxa inferred from ITS sequences of nuclear ribosomal DNA // Taxon, 2002. – Vol. 51. – P. 91–101.
Downloads
Published
2019-06-17
Issue
Section
Molecular methods in the study of plants and chemosystematics
How to Cite
Species determination in Liparis (Orchidaceae) based on morphological and molecular data on the territory of “Muravyevsky park of sustainable use of natural resources”: УДК 575.222.582.594.6(470). (2019). Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 18(1), 75-79. https://doi.org/10.14258/pbssm.2019014
